bmod
介绍
bmod用于修改已提交作业的参数。
注意
- 任务运行时减少申请的资源，不会减少任务实际使用的资源，所以其它job运行后可能会使节点资源负载过高
参数说明
| 选项 | 功能描述 | 主要差异 |
|---|---|---|
-help | 打印命令用法并退出 | 实现了更详细的帮助信息 |
-V | 打印版本号 | 无差异 |
-version | 打印版本信息 | 无差异 |
-G | 修改用户组名 | 对应account字段 |
-Gn | 取消用户组名设置 | 无差异 |
-P | 修改项目名称 | 对应wckey字段 |
-Pn | 取消项目名称设置 | 无差异 |
-r | 启用自动重新排队 | 无差异 |
-rn | 禁用自动重新排队 | 无差异 |
-w | 修改作业依赖关系 | 支持done(id)、ended(id)、exit(id,code)形式 |
-wn | 取消作业依赖关系 | 无差异 |
-cwd | 修改作业工作目录 | 无差异 |
-cwdn | 取消工作目录设置 | 无差异 |
-o | 修改标准输出文件(追加模式) | 无差异 |
-on | 取消标准输出文件设置 | 无差异 |
-oo | 修改标准输出文件(覆盖模式) | 无差异 |
-sp | 修改作业优先级 | 无差异 |
-spn | 取消作业优先级设置 | 无差异 |
-J | 修改作业名称 | 无差异 |
-Jd | 修改作业描述 | 无差异 |
-Jdn | 取消作业描述 | 无差异 |
-Jn | 取消作业名称设置 | 无差异 |
-R | 完全替换资源需求规格 | 仅支持rusage[mem=X]（内存MB）、rusage[tmp=X]（临时磁盘MB）、span[ptile=X]（每节点任务数）、span[hosts=X]（节点数） |
-Rn | 取消资源需求设置 | 无差异 |
-x | 设置独占节点分配 | 无差异 |
-xn | 取消独占节点分配 | 无差异 |
-m | 修改执行主机列表 | 无差异 |
-mn | 取消执行主机列表设置 | 无差异 |
-n | 修改任务数量(min_tasks[,max_tasks]) | 无差异 |
-nn | 取消任务数量设置 | 无差异 |
-q | 修改队列名称 | 无差异 |
-qn | 取消队列名称设置 | 无差异 |
-U | 修改预留名称 | 无差异 |
-Un | 取消预留设置 | 无差异 |
-b | 修改作业开始时间 | 无差异 |
-bn | 取消作业开始时间设置 | 无差异 |
-t | 修改作业终止截止时间 | 无差异 |
-tn | 取消终止截止时间设置 | 无差异 |
-W | 修改运行时间限制([hour:]minute) | 无差异 |
-We | 设置预估运行时间([hour:]minute) | 无差异 |
-We+ | 增加运行时间([hour:]minute) | 在当前TimeLimit基础上增加 |
-Wen | 取消预估运行时间设置 | 无差异 |
-Wep | 按百分比延长运行时间 | 按当前TimeLimit的百分比延长 |
-Wn | 取消运行时间限制设置 | 无差异 |
job_id参数
| 参数格式 | 功能描述 | 主要差异 |
|---|---|---|
job_ID | 修改指定ID的作业 | 无差异 |
job_ID[index] | 修改数组作业的指定任务 | 无差异 |
job_ID[start-end] | 修改数组作业的指定范围任务 | 无差异 |
集群配置
修改以下配置，以使用支持更改运行中任务资源请求的插件select/cons_tres_ex
SelectType=select/cons_tres_ex
运行中作业修改限制
对于运行中（RUNNING状态）的作业，bmod仅支持修改以下参数：
| 参数类别 | 支持的选项 | 说明 |
|---|---|---|
| 内存资源 | -R "rusage[mem=X]" | 修改内存需求 |
| 时间限制 | -W, -We, -We+, -Wep, -Wn, -Wen | 修改运行时间限制 |
| 重新排队 | -r, -rn | 启用/禁用自动重新排队 |
对于等待中（PENDING状态）的作业，可以修改所有支持的参数。
对于已完成的作业，无法修改任何参数。
使用示例
-
修改运行中作业的内存需求
[root@head-1 ~]# bsub -R "rusage[mem=8000]" sleep 300
Job <303> is submitted to default queue.
[root@head-1 ~]# bsub -R "rusage[mem=8000]" sleep 300
Job <304> is submitted to default queue.
[root@head-1 ~]# bjobs
JOBID USER STAT QUEUE FROM_HOST EXEC_HOST JOB_NAME SUBMIT_TIME
303 root RUN partition- head-1 compute-1 sleep 300 Dec 5 14:52
304 root PEND partition- head-1 sleep 300 Dec 5 14:52[root@head-1 ~]# bmod -R "rusage[mem=1000]" 303
Parameters of job <303> are being changed
[root@head-1 ~]# bjobs -l
Job <303>, User <root>, Project <*>, Status <RUN>, Queue <partition-9C3RA>, Command <sleep
300>
Dec 5 14:52: Submitted from host <head-1>, CWD </root>, Output File </dev/null>, Error File
</dev/null>, Requested Resources <rusage[mem=1000]>;
Dec 5 14:52: Started 1 Task(s) on Host(s) <compute-1>, Allocated 1 Slot(s) on Host(s)
<compute-1>, Execution Home </root>, Execution CWD </root>
Dec 5 14:55: Resource usage collected.
MEM: 0 Mbytes; NTHREAD: 3
PGID: 16165; PIDS: 16165
PGID: 16172; PIDS: 16172 16174
MEMORY USAGE:
MAX MEM: 0 Mbytes
------------------------------------------------------------------------------
Job <304>, User <root>, Project <*>, Status <RUN>, Queue <partition-9C3RA>, Command <sleep
300>
Dec 5 14:52: Submitted from host <head-1>, CWD </root>, Output File </dev/null>, Error File
</dev/null>, Requested Resources <rusage[mem=8000]>;
Dec 5 14:53: Started 1 Task(s) on Host(s) <compute-1>, Allocated 1 Slot(s) on Host(s)
<compute-1>, Execution Home </root>, Execution CWD </root>
Dec 5 14:55: Resource usage collected.
MEM: 0 Mbytes; NTHREAD: 3
PGID: 16192; PIDS: 16192
PGID: 16199; PIDS: 16199 16201
MEMORY USAGE:
MAX MEM: 0 Mbytes -
修改作业名称
bmod -J "new_name" 12345 -
修改作业队列
bmod -q normal 12345 -
修改临时磁盘需求
bmod -R "rusage[tmp=10240]" 12345 -
修改作业依赖关系
bmod -w "done(12344)" 12345 -
启用自动重新排队
bmod -r 12345 -
修改运行时间限制
bmod -W 120 12345